Thèse en Biologie, Soutenue par Fatimetou Mint Mohamed El Moctar sous la codirection de Pr, Mohamed Val Mohamed Abdellahi de l'Université de Nouakchott et Pr. Josette Raymond, Université Paris Descartes ; Hôpital Cochin- France. (19/07/2021)
Mots clés :
Helicobacter pylori ; gène cagA, motif EPIYA ; PCR ; clarithromycine, Mauritanie
Formation doctorale :
Formation doctorale en Biologie, Ecole doctorale des Sciences et Technologies, Université de Nouakchott
Résumé
Francais
Anglais
Arabe
Francais
Helicobacter pylori est responsable de diverses maladies gastriques, notamment le cancer. Il a évolué avec l’homme. Les migrations humaines ont façonné l’expansion et la diversité de souches dans le monde entier. Le risque de développer une maladie est en partie lié à la presence de facteurs de virulence, la protéine CagA (oncogène) et la cytotoxine VacA. L’objectif de cette étude était de déterminer la prévalence du gène CagA codant pour la protéine CagA chez les souches de H. pylori isolées de patients mauritaniens, et de chercher une relation avec les aspects endoscopiques et histologiques.
Matériels et méthodes : H. pylori était recherché dans des biopsies gastriques réalisées lors d’une endoscopie haute chez les patients présentant des symptômes gastroduodénaux. La présence de H. pylori et sa résistance à la clarithromycine étaient détectées par RT-PCR. La présence de cagA était déterminée par PCR et le polymorphisme des motifs EPIYA-cagA par séquençage.
Résultats : Au total, 97,4% biopsies étaient positives. Le taux de résistance à la clarithromycine était de 5,26 %, dû à la mutation A2143G avec une population mixte (S+R) dans 2 cas. Le gènecagAétait présent dans 30,26% des biopsies et le motif EPIYA était ABC dans 91,3% de cas. Une charge bactérienne et une inflammation plus sévèreétaientsignificativement associées à la présence de cagA (p <0.01). L’analyse phylogénétique des gènes glmM et hspA a permis de montrer un mélange de gènes d’origine africaine (hspA) et européenne (glmM) dans des souches de H. pylori isolées de patients d’origine maure reflétant l’histoire du pays.
Conclusion : Cette étude met en évidence une forte prévalence de l’infection à H. pylori chez les patients mauritaniens, un faible taux de résistance à la clarithromycine. Elle met en évidence la relation entre présence du gène cagA, forte charge bactérienne et sévérité del’inflammation. L’analyse phylogénétique met en évidence le mélange de différentes populations dans la population Maure.
Anglais
Background: Helicobacter pylori (H. pylori) is responsible of various diseases including cancer. It co-evolved with human. Human migrations shaped the expansion and the diversity of strains around the world. The risk to develop a disease depends on virulence’s factors, mainly the cytotoxin- associated gene A protein (CagA). The aim of this study was to determine the prevalence of the presence of CagA in H. pylori strains isolated from Mauritanian patients, and to look for a relationship with endoscopic and histological findings.
Material and methods :H. pylori was searched in gastric biopsies taken during an endoscopy in patients with gastro-duodenal symptoms. The diagnostic and detection of the resistance to clarithromycin were performed using RT- PCR. The presence of cagA was determined by PCR and the EPIYA-cagA motifs polymorphism by sequencing.
Results: At all, 97.4% biopsies were positive for H. pylori. The rate of clarithromycin resistance was 5.26%, due to the A2143G mutation with a mixed population (S+R) in 2 cases. The cagA gene was present in 30.26% biopsies, and EPIYA motif was ABC in 91.3% cases. Higher bacterial load and inflammation were significantly associated with a cagA positive strain (p <0.01). The phylogenetic analysis of the glmM and hspA genes highlighted a mixture of African and European genes in strains of H. pylori isolated from patients of Moor origin.
Conclusion: We report a high prevalence of H. pylori infection in Mauritanian patients, a low rate of clarithromycin resistance and a higher bacterial load and inflammation associated with a cagA positive-status. The phylogenetic analysis highlights the mix of different populations reflecting the history of the Moorish population.
Arabe
